НИИ фундаментальной и клинической иммунологии был создан в 1981 году на базе отдела иммунологии Института клинической и экспериментальной медицины СО РАМН.
Приоритетные направления работы Института включают:
-исследование молекулярно-генетических механизмов регуляции процессов активации, пролиферации и дифференцировки клеток иммунной системы в норме и при иммунопатологических состояниях и разработку новых методов иммунокоррекции на основе клеточных биотехнологий и генно-инженерных продуктов;
-исследование механизмов регуляции стволовых клеток и клеток-предшественников и разработку высокоэффективных биотехнологических методов в лечении основных заболеваний человека;
-исследование молекулярно-генетических механизмов формирования полиморфизма иммунной системы как основы для разработки новых методов оценки здоровья, прогноза развития и лечения иммунопатологических состояний.